結論からいうと、問題はありません。

ホワイトニングの基剤である過酸化水素は、米国食品医薬品局（ＦＤＡ）でも成分の安全性を保障しており、ホワイトニング剤自体は、その安全性をＡＤＡ（米国歯科医師会）が認めています（全ての製品がＡＤＡマークではありません）。

これまでホワイトニングが先行しているアメリカで、数千万人が体験していますが、事故報告は1件もありません。　 　　

但し、エナメル質の表面に微小な形態変化を与えることは事実です（電子顕微鏡レベルでの変化）。
歯は通常、カルシウムとリンが飛び出す脱灰と、再び元に戻る力である再石灰化を繰り返しており、そういった意味では、ホワイトニングによる歯の形状変化はダメージの範疇に入るものではないと考えます。

低濃度の過酸化水素であれば、作用は歯のエナメル質の4％を占める有機化合物の色素を分解することに能力が費やされ、エナメル質の96％を占める無機化合物には影響を与えません。
ただし、過酸化水素の濃度があまりにも高かったりした場合には、エナメル質の無機化合物にも影響を与える恐れがあります。